匿名希望さん  女性  45歳

ご参考になるかわかりませんが。

私もやりとりした方のメッセージが全く消えたことがありました。
私の場合は状況的にブロックされたことが明らかだったのですが、履歴が全部消えるのはちょっと謎でした。

調べてみたら
・PC からの閲覧だと全部消えてる
・アプリだと｢退会しました｣

というような見え方でした。

あと、ご相談文からは読み取れませんでしたが、
ものすごく長い期間のメールやりとりだったら、
一定の保存期間を過ぎると自動で削除される仕様だったと思います。
(3ヶ月か６ヶ月だったかと)